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TIBCO Spotfire

Tibco Spotfire是实验室海量数据分析的商业智能分析工具,能够对数据进行可视化的实时分析、统计及探索。它能够将结构式、文字、数据、图像、属性和检测数据等数据信息结合在一起,使您能够执行复杂的分析和创建简洁易用的功能面板。您可以自主创建所需的分析模板,获得您所期待的数据挖掘信息。同时Spotfire支持直接与我们的E-Notebook整合,从而让科研工作者更深入地探索实验数据,加速科研进程。


Lead Discovery组件可帮助TIBCO Spotfire软件导入、呈现和分析化学结构,生物分子序列。科学家们可以在Spotfire分析平台中合并化学和生物数据表,并利用交互可视化、过滤功能和统计分析方法迅速获得符合筛选条件及化学结构的目标化合物,同时可进行生物大分子序列、氨基酸残基的比对,联配以及分析。

Lead Discovery的主要功能包括:

1、化学结构查看和过滤:可查看molfiles、SMILES、Chemdraw等格式文件或者化合物数据库中的结构,并可根据可信相似度和子结构算法进行结构过滤,筛选,导入和导出SD文件;

2、R基团分析:只要为一系列相关结构确定一个通用骨架,Lead Discovery 就可以分析并显示所有相连的R基团,从而帮助科学家确定最佳的取代方式和取代基,协助先导化合物的优化;

3、子结构搜索并突出显示匹配结果:从数据库导入结构信息时,即可实现;

4、导入时自动检测结构格式:可保留需要的化学结构式,使其不会再转换过程中丢失。

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Lead Discovery Premium的主要功能包括:

1、序列分析:能够对生物大分子多肽、核酸、蛋白质等进行2D、3D结构展示,并通过树状图来描述不同序列的相似性,利用自定义的形式对表单进行配置,帮助科学家发掘生物大分子数据之间潜在的关系;

2、自动更新化合物、基团数据:自动更新并重新计算新添加的化合物以及R基团的属性,可通过功能基团富集来高亮有效R基团;

3、Webservice:自身集成至外部Webservice服务框架,并可通过自定义的形式添加JavaScript开发脚本。

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Spotfire的High Content Profiler套件,可快速将高内涵筛选数据转换为有意义的生物学结论。High Content Profiler可提供一整套自动化的workflow来指导科学家进行高内涵数据的清洗、整理、检测、降维、聚类、分类、回归以及机器学习算法的应用。

1、在单一平台上进行完整的数据分析和验证,节约宝贵的时间并降低成本;

2、采用先进的统计学、分类回归和机器学习方法;

3、通过一键操作,即可执行全面彻底的QC分析、可靠的归一化处理、多元分层和药物响应分析;

4、支持基于孔、基于细胞等分析类型;提供RNAi干扰剂、大小分子等高内涵数据类型;

5、支持与Columbus(一款细胞学图像数据存储和分析系统)无缝对接,并提供Image Discovery分析模块进行图像展示,从而分析细胞各个参数随不同剂量的化合物变化结果;

High Content Profiler让科学家可以将高内涵筛选数据分析提高到更高水平。有助于进行先导化合物的筛选,有助于利用SAR分析对已确定的候选药物进行验证,有助于通过qPCR分析流程理解深层分子机制.